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> 私は何年か前に抜歯をしてもらったのですが、ちょうどその歯の下に
> コリコリしたものがあります。
> たまーに疲れた時とかに痛くなる程度です。
> 他の歯科医院でレントゲンを撮ってもらって異常なしというこてでしたが、
> 痛くなるってことは、やっぱり変なんでしょうか？我慢できないほどの痛みではありません。

実際にお口の中、レントゲン等を見ないとなんとも言えません。

> それとフロスを使うと引っかかるってことはやっぱり虫歯になってるのでしょうか？レントゲンで写ってなくても虫歯になってることってあるのでしょうか？

フロスが引っかかるという事は、虫歯である可能性もあります。
レントゲンでは見えづらい虫歯もあります。